Екипът на Астрономическия Център осъществява и активна научно-изследователска дейност, свидетелство за което са публикациите в престижни международни астрономически издания. Членове на колектива са участвали в разработката на 2 международни и 6 национални научно-изследователски проекти. Особено плодотворно е дългогодишното сътрудничество (от 1987 г.) с астрономическите екипи на Педагогическия университет и Ягелонския университет от Краков (Полша).

Екипът на Астрономическия Център провежда регулярно фотометрични наблюдения в Обсерваторията Mt Suhora (Полша) и спектрални наблюдения в Националната Астрономическа Обсерватория–Рожен.